Après avoir été ressuscité et expédié deux siècles et demi plus tard, Ichabod Crane se retrouve dans le Sleepy Hollow d'aujourd'hui, où il réalise que le Mal s'est réveillé avec lui. Quand le shérif August Corbin est tué par l'infâme Cavalier sans tête, Ichabod se lie avec le Lieutenant Abbie Mills, une jeune policière qui a eu une enfance avec des épisodes surnaturels. Ils se donnent pour mission d'éliminer le Mal et de découvrir les mystères de la fondation du pays. Le Capitaine Franck Irving a du mal à croire aux histoires de maléfices surnaturels d'Ichabod, mais lorsque les présages de malheurs émanant de Katrina, l'ex-femme d'Ichabod, se manifestent, tous comprennent enfin que la ville est tout sauf endormie.